由于網絡邊界的虛擬化使傳統網絡邊界的防護手段失效。在傳統的網絡結構中，網絡邊界一般通過物理的服務器、網絡設備、網絡接口進行識別，防火墻和入侵檢測設備可以采用串接和旁路的方式捕獲進出邊界的流量并按照預設的策略執行防護動作。但隨著虛擬化實施之后，系統之間的邊界不單單是以物理設備的形式存在。比如在物理服務器中虛擬出多個服務器，這些虛擬機之間以及虛擬機與宿主機之間的通信都只會在服務器內完成，不會與外部網絡發生交互，傳統的邊界防護設備捕捉不到這些流量，也就不能進行防護。因此基于物理設備進行邊界防護的手段不適用于對虛擬化環境的邊界保護。
　　虛擬系統數量的快速增長帶來的對計算環境基礎防護軟件管理的難題和資源消耗的難題。在傳統安全中，病毒防護和系統補丁是每個服務器都必須采取的基本安全措施，在應用虛擬化環境之后，這樣的安全防護仍然是最基本也是必須的。但問題在于，由于虛擬系統的數量較物理系統數量大大增加，為每個虛擬系統都進行病毒防護和補丁管理將大大提高系統管理的成本;另一方面，每個虛擬系統采用這樣的防護手段將占用物理系統大量的存儲資源，如果虛擬系統同時進行病毒查殺，更會占據物理服務器的運算資源，降低系統對外提供服務的能力。
　　虛擬化管理工具自身缺乏保護措施帶來的隱患。虛擬化管理工具為快速配置虛擬化環境提供了極大的方便，但也正是由于這個原因，導致它極易受到攻擊。一旦惡意攻擊者獲得管理工具的權限，給整個虛擬化環境帶來的危害將是巨大甚至是災難性的。